硒在自然界呈点状分布。独立硒矿床分布极少,硒资源主要存在于综合性的矿床中,其中主要成矿类型为斑岩铜矿和铜钼矿床。世界范围内富硒国家为日本、德国、比利时、加拿大、俄罗斯、智利、芬兰、菲律宾等。我国是世界范围内地理环境硒缺乏范围最广、缺硒程度最严重的国家之一。我国地壳中硒的平均丰度为0.058mg/kg,低于地球地壳硒的平均值0.070mg/kg。我国有70%以上的耕地处于不同程度的缺硒状态,其中约30%的耕地严重缺硒。湖北、陕西、湖南、浙江、江西、四川、重庆、广西、广东、海南、贵州、福建、江苏、甘肃、北京、河北、河南、宁夏、黑龙江、云南等24个省份存在天然的富硒土壤。其中最为典型的是湖北省恩施市。位于恩施市鱼塘坝及双河的硒矿,一般含硒量为0.0047～0.035,局部高达0.112～0.54%,平均为0.0084%,是地球硒克拉克值的1628倍,
因此是全球最高的含硒区。恩施市也因此于2011年被第十四届国际人与动物微量元素大会授予"世界硒都"称号。
李海蓉等通过文献调研绘制了我国硒元素生态景观类型图,见下图。